Filtre pre čisté priestory, známejšie ako filtre HEPA, ako už ich názov napovedá, dokážu splniť požiadavky na prostredie s mimoriadne vysokou čistotou vzduchu, pokiaľ ide o kvalitu filtrovaného vzduchu. Filtre HEPA sa používajú v oblastiach, kde je potrebné zo vzduchu odfiltrovať nielen prach a hrubé častice, ale aj peľ a jemné častice. V závislosti od jemnosti filtračného média môže filter obsahovať aj baktérie a mikročastice (0,4 mikrónu), preto je bezpečné používať toto filtračné riešenie na filtráciu vzduchu v sterilných priestoroch. Priemyselné filtre pre čisté priestory sú jednoznačne moderným prostriedkom na vstrekovanie vzduchu a jemnú filtráciu v oblasti vzduchotechniky.
Vo filtroch HEPA, teda filtroch pre čisté priestory, je filtračné médium vo väčšine prípadov namontované na nejakom kompozitnom alebo kovovom ráme, čo je v podstate z praktických, úžitkových dôvodov. Zvyčajne sú pre HEPA filtre k dispozícii tieto rámové riešenia: MDF, hliník, plast, kovový profil, povrchovo upravená alebo pozinkovaná oceľ. Prevažnú väčšinu filtračných médií tvorí nejaká forma mikrovlákna zo sklenených vlákien, perina z mikrovlákna zo sklenených vlákien alebo podobné kompozitné riešenie obsahujúce tkaninu zo sklenených vlákien a iné filtračné médiá.
Štandardné inštalačné hĺbky priemyselných filtrov do čistých priestorov sú 78mm, 150mm, 292mm, ale filtre do čistých priestorov sú samozrejme k dispozícii aj vo vlastných veľkostiach a v prevedení na mieru od výrobcov. Účinnosť odlučovania filtrov pre čisté priestory sa môže značne líšiť. Zatiaľ čo filter pre čisté priestory kategórie E10 má účinnosť odlučovania 85%, filter H13 môže poskytovať 99,95% a filter U16 môže poskytovať laboratórny čistý vzduch s účinnosťou filtrácie 99,99995%.